反相色譜柱是以十八烷基硅烷鍵合硅膠為填料，因此有較高的碳含量和更好的疏水性，對各種類型的生物大分子有更強的適應能力，適用范圍較廣，是高效液相色譜儀分析中首要選擇的色譜柱類型。
目前，反相色譜柱適用范圍廣，從極性化合物到非極性化合物都可獲得良好的分離，在碳水化合物如低聚糖、苷類糖化學，生藥學和天然產物化學，生物物質如多肽、蛋白、核酸等多個領域發揮重要作用。
反相色譜柱的結構及主要功能：
本產品是由柱管、接頭、封頭、密封環、壓帽、篩板、柱填料等組成。
1、柱管：多用不銹鋼制成，壓力不高于70kg/cm2時，也可采用厚壁玻璃或石英管，管內壁要求有很高的光潔度。為提高柱效，減小管壁效應，不銹鋼柱內壁多經過拋光。也有人在不銹鋼柱內壁涂敷氟塑料以提高內壁的光潔度，其效果與拋光相同。
2、接頭：柱兩端連接流動相與柱管的中空環套，由不銹鋼制成。用于柱管路聯通與柱端高壓固定。
3、封頭：柱兩端的密封螺絲，用于保存色譜柱時封頭。
4、密封環：位于接頭螺旋環內壁的彈性環，多為聚四氟乙烯制成，用于反相色譜柱兩端壓帽與柱外壁的密封。
5、壓帽：即色譜柱兩端套合于柱管端外壁的塑性圓柱帽，中部有小孔，多為聚四氟乙烯制成，用于固定篩板。
6、篩板：位于反相色譜柱兩端緊貼柱管端的篩網狀薄片，由燒結不銹鋼或鈦合金制成，孔徑取決于填料粒度，一般為0.2~20&um(5~10&um)。用于防止填料從柱管內漏出。
7、柱填料：裝填于柱管內的固定相擔體，其直接決定了反相色譜柱的類型與用途，是色譜柱的核心。多為無定形或球形硅膠基質，也有環糊精、活性炭、聚苯乙烯-二乙烯基苯、聚甲基丙酸酯、氧化鋁等基質。用于色譜分離。
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